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想要查询手机号码是否由本人身份证注册，可以通过以下几种方法。
1、使用移动/联通/电信运营商的官方APP查询：
登录对应的运营商APP（如移动手机营业厅APP等），在“我的”或“个人中心”页面通常会有个人信息和办理过的业务栏目，可以查询到相关信息。
2、拨打运营商客服电话查询：
直接拨打手机运营商的客服电话（如移动拨打10086，联通拨打10010等），报上身份证号码查询该身份证注册过的手机号码。
3、前往营业厅查询：
可以携带身份证原件到附近的运营商营业厅查询，出示身份证原件并提供身份证号码后，工作人员会帮助查询并告知该身份证注册的手机号码。
4、微信查询：部分城市支持微信查询手机号是否实名注册，可以关注相关的微信公众号并绑定手机号码后进行查询。
5、支付宝查询：部分地区的支付宝可能提供此类服务，可以在支付宝的“市民服务”或其他相关功能中查找并查询。
无论使用哪种方法，都需要确保个人信息安全，避免泄露给非官方或非信任来源，如果发现有未经授权的手机号码注册在自己名下，应立即联系相关运营商进行更正或注销，以上方法仅供参考，具体操作可能因地区和运营商而异，建议根据实际情况选择最适合自己的查询方式。